截止2019年7月m6A热点领域10分+研究盘点 m6A专题_主页
截止2019年7月m6A热点领域10分+研究盘点 m6A专题
更新时间:2019-08-19
 

  有人担心m6A被人做烂了?其实这是多余的。热点和做烂的区别在于,烂大街就是人人谈论的科研热点已经习以为常,Pubmed上文章数量每年会超过几百篇且整体影响因子大多集中在5分以下。而热点则还在处于开荒抢山头的阶段。

  来自康奈尔大学的Jaffrey一直是m6A领域的大牛,今年7月刚刚online一篇Nature。可是仔细研究发现,这篇文章所涉及的领域完全是Jaffrey课题组原来没有涉及过的——相分离。

  同样在今年,哈佛大学著名华人女科学家庄小威也在预印本bioRxiv上发现,m6A修饰能够促进YTHDF蛋白的相分离。这篇文章第一作者正是大名鼎鼎的付晔(FTO蛋白去甲基化酶的发现者之一,另一位是贾桂芳,目前已转战植物领域)。从何川老师实验室读完PhD后,付晔马上前往哈佛的庄小威实验室进行博后训练。

  清华大学的李丕龙课题组也在今年8月于Cell Research发表m6A相分离研究。

  上面三位大牛的故事说明,m6A的研究还远远没有达到烂大街的程度,相反RNA表观修饰正在开启一扇新的大门。除了基础生物和医学领域,植物学也在今年相继发力。

  除了宋卫宁在PBJ发表的一篇综述外,中山大学的陈月琴课题组也发现水稻的甲基化转移酶FIP37和MTA2能够调节早期孢子发育。北京大学的贾桂芳课题组则在暗暗憋大招,估计也会冲击CNS主刊级别的杂志。

  有意思的是中国科学院植物研究所的秦国政与田世平,算是目前为数不多将DNA甲基化与RNA甲基化联系起来的课题组。这篇发在Genome Biology的文章发现,DNA甲基化可通过调节m6A去甲基化酶基因表达的方式影响番茄果实m6A修饰,而m6A去甲基化酶反馈调节DNA甲基化,从而共同调控果实成熟。

  在免疫领域,清华大学徐萌/北京基因组研究所韩大力与中国医学科学院曹雪涛院士在树突状细胞上也分别发表了一篇Nature和一篇Nature Communications。

  除了上面提到的NC,曹雪涛院士还在Science主刊、Immunity、PNAS各发表高水平论文三篇,不仅高产还高质。

  心血管领域,Circulation今年已经连续Online了两篇m6A论文。遵义医科大学的张志勇课题组也是首次在Autophagy上发现m6A修饰能够调节缺血性心脏病的重要功能。

  南方医的夏新来老师则非常硬核,看标题就很朋克——人类胚胎全转录组m6A图谱。这也是第一篇关于人类胚胎组织的m6A研究,揭示了m6A在人类组织发育和稳态调控中的潜在功能。

  从Resource这个文章类别来看,就可以得知这篇文章举足轻重的分量。当然这篇文章的组织来源于捐献,伦理这关肯定是要过的。所以有时候第一篇文章,尤其是占坑的高分文章各个环节因素都会影响论文发表。

  来自中山大学肿瘤防治中心林东昕/郑健中肿课题组与徐瑞华课题组发现吸烟及二手烟导致胰腺癌的新机制,促进miRNA的m6A修饰,诱导胰腺癌发生发展。

  这篇文章逻辑比较有看点,不过整体思路仍然沿袭联川生物客户在2015年发表的Nature和Cell中的观点,即m6A修饰促进miRNA初级体加工(和)。

  林东昕/郑健中肿课题组与北京课题组协同徐瑞华课题组在前期进行了大量工作。这项多中心的研究中,入组的胰腺癌病人队列数量超过100名,其中中大肿瘤入组人数102人,中国医学科学院附属肿瘤医院入组人数73人(样本来源横跨2010年-2016年之久)。

  最后要详细介绍的是中山大学的骆观正老师(师从何川与潘涛老师),今年在Science Advanced出品了一篇非常具有划时代意义的论文。利用MazF酶识别ACA motif从而实现单碱基分辨率的m6A测序新方法。这种方法不依赖m6A抗体,可以大大降低RNA起始量。

  有点可惜的是Cell上,来自以色列的Schraga Schwartz课题组也有类似的研究发表,可见学术圈在新热点追逐上已经到了白热化的地步。

  由于篇幅限制,无法介绍今年所有的研究。其实国内外大牛今年m6A领域的许多论文都很有看点。

  例如哥伦比亚大学的Lei Ding在NCB发表文章首次在体内METTL3对造血干细胞的影响与体外条件下完全相反(与陈建军及Jaffrey的部分结论有出入),且m6A不影响髓系细胞的分化。

  另外康奈尔大学的钱书兵、上海中山医院樊嘉院士、中山大学药学院王红胜、哈佛大学施扬、华中农大彭健蒋思文、中大肿瘤孙颖、南京医科大学魏继福、美国西北大学马永超、南方科技大学姬生健、中大一附院纪卫东等都相继发表了高水平的研究。

  我们再来看看历年趋势就可以知道,m6A正处在一个井喷的状态。2012年之前,受限于高通量测序工具开发以及FTO的功能未被完全阐释,文章数甚至是从2011年到2012年出现了小幅度下滑的情况。

  但是到2017年之后,m6A研究的文章数量突破100篇,开始引起各领域研究者的关注。

  2018年的国自然中标情况,更多反应的是基金标书撰写者在2017年之前的准备工作。所以这里超过100篇文章数量绝对是一个很好的时间节点。

  再来看看2018年的国自然热点,我们发现虽然m6A资助的项目数量不多,但是与2016年与2017年比起来可谓增量不小。这67项资助项目平均资助额度超过45万,总计资助额度接近3000万。

  从上图我们可以看到,这是去年总计中标的项目,绝大部分还集中在基础医学这块,而其中肿瘤是热点中的热点。

  肿瘤领域关注的人开始增多,且5分以上的文章占比超过50%,这些证据表明m6A仍处于“初级阶段”,值得各位老师投入大量精力和金钱去做一些研究。

  现在打下的良好基础可以为明年的研究开一个好头。所以各位老师,你还在等什么呢?返回搜狐,查看更多香港挂牌之全篇记录